Affettare finemente le zucchine e rosolale in una padella calda con olio d'oliva e aglio (intero o grattugiato, a seconda dei gusti).
Aggiungere sale e pepe a piacere, e cuocere finché le zucchine non diventino morbide e caramellate. Verso fine cottura, aggiungere anche alcune foglie di menta fresca se desiderate.
Abbassare la fiamma e cospargere le zucchine con la farina, quindi mescolare bene fino a quando tutte le zucchine non saranno ricoperte.
Aggiungere la noce moscata e il latte vegetale, leggermente caldo, mescolare bene e lasciare addensare la salsa (ci vorranno da 2 a 5 minuti). Mettere da parte a raffreddare.
Aggiungere tutti gli ingredienti per l'impasto nel boccale di una planetaria o del Bimby, quindi lavora l'impasto per 10 minuti con il gancio (o farfalla a velocità 4).
Ungere con margarina (o burro vegetale) una teglia rotonda da 24 cm con i bordi alti (di almeno 8 cm), e versare circa ⅔ dell'impasto.
Aggiungi il ripieno cremoso di zucchine nel centro, avendo cura di lasciare almeno 1 cm di bordi, quindi ricoprire l'impasto rimanente, facendo in modo di lasciare dell'impasto in eccesso intorno ai lati affinché i bordi si sigillino bene tra loro durante la lievitazione.
Cospargere la superfcie con dei semi di sesamo bianchi e neri (facoltativi), e lascia lievitare fino a quando la pizza rustica non avrà raddoppiato di dimensioni (circa 1 ora e mezza).
Preriscaldare il forno a 180°C e cuocere la pizza babà vegana con zucchine per 30-40 minuti.
Lasciar raffreddare per almeno 15 minuti prima di servire.